花蓮縣地方稅務局表示，購買未辦保存登記的房屋，應由買受人報繳契稅，但買賣移轉未辦保存登記之房屋，因無法向物權登記機關辦理變更登記，所立向稅捐稽徵機關辦理契稅申報之契據，非屬向主管機關申請物權登記之契據，免貼印花稅票。

地方稅務局指出，所謂未辦保存登記房屋，係指沒有到地政機關辦理所有權登記的房屋。如果購買未辦保存登記的房屋，買賣雙方應於訂立契約之日起30日內，填具契稅申報書，並檢附「公定格式契約書」及買賣雙方身分證明文件影本，共同向房屋所在地鄉鎮（市）公所申報繳納契稅。逾期申報者，每逾3日加徵應納稅額1%之怠報金。

而對於買賣移轉未辦保存登記之房屋，因為房屋未符合相關規定致無法辦理建物所有權第1次登記（即保存登記），除嗣後能依程序補正而變成合法建築物外，係客觀上不能辦理移轉登記，而無法為不動產所有權之讓與，縱實務上雖認為讓與人已將違章建築之事實上處分權，因建築物之交付而歸諸受讓人，惟仍無從辦理物權登記。

依據財政部94年8月2日台財稅字第09404749360號函釋：「買賣移轉未辦保存登記之房屋，因無法向物權登記機關辦理變更登記，其所立向稅捐稽徵機關辦理契稅申報之契據，尚非屬印花稅法第5條第5款規定「向主管機關申請物權登記之契據」。」免貼印花稅票。

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